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單細胞DNA-seq
技術簡介:
MissionBio 高通量單細胞靶向DNA測序能夠在單細胞水平檢測基因拷貝數變化、單堿基突變、插入缺失及蛋白質表達等,充分展現細胞間遺傳異質性,助力腫瘤的耐藥機制研究,揭示腫瘤發展軌跡、克隆結構,鑒定及純化基因編輯產物等。2018年,獲美國The Scientist評選的10大科技創新產品獎。
技術原理:
MissionBio的Tapestri平臺基于微液滴的微流控裝置,利用油包水體系對細胞進行捕獲與封裝。封裝時,細胞和蛋白酶等會被一起裝入微液滴中,每一個微液滴相當于一個微容器。之后,細胞在微液滴中進行裂解、加條形碼(barcoding)等步驟,再結合靶向 PCR 擴增技術,對特定的DNA目標序列進行單細胞水平的建庫。建庫完成后,即可進行高通量測序和后續的生物信息學分析。
技術特點:每個細胞可捕獲>300個目標區段的DNA序列;
高靈敏度,可檢測含量低至0.1%的罕見亞克隆,以及突變的合子型和突變共發生情況;
多種檢測類型,可檢測SNV、InDel及CNV等多種變異類型;
高通量,每個樣本可測量5,000 ~ 10,000細胞;
靈活性強,可定制化設計疾病基因檢測靶點及CRISPR靶點;
實驗周期:從收到組織或細胞樣本開始至拿到數據,周期為20個工作日;
定制Panel周期:2-4周
數據質量:PE150進行測序,測序質量Q30≥80%,
標準數據分析:
服務代碼:4base-scDNA-seq
訂購指南:order@4basedx.com