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    單細胞甲基化組測序scRRBS

    DNA甲基化是最早發現的基因表觀修飾方式之一,真核生物中的甲基化僅發生于胞嘧啶,即在DNA甲基化轉移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5’-端的胞嘧啶(C)轉變為5’-甲基胞嘧啶(5mC), 其參與調控了基因表達。在哺乳動物體內,DNA甲基化在分化細胞中相對穩定;相比之下,在早期胚胎發育和原始生殖細胞發育過程中會發生基因組范圍的去甲基化和DNA甲基化譜式的再建立。    

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    特異甲基化PCR擴增實驗服務(Methylation-Specific PCR)

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    服務代碼:4base-Methyl-PCR

    訂購指南:order@4basedx.com


    全基因組染色質開放區域測序Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing (ATAC-Seq)

    DNA的復制轉錄是需要將DNA的緊密結構打開,從而允許一些調控因子結合(轉錄因子或其他調控因子)。多數基因組中的染色質都緊緊盤繞在細胞核內,但也有一些區域經染色質重塑后呈現出松散的狀態,這部分無核小體的裸露DNA區域被稱為開放染色質(open chromatin),而DNA復制和基因轉錄都發生在這些區域。染色質的這種特性叫做染色質的易接近性(chromatin accessibility),或者開放性,通過研究細胞特定狀態下開放的染色質區域可以在DNA水平上了解其轉錄調控。

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    開放染色質的研究方法有很多,如ATAC-seq、DNase-Seq、MNase-seq及FAIRE-seq等。相比較于其他技術,ATAC-Seq所需細胞量少,利用Tn5轉座酶切割未結合核小體或蛋白基因組區域,所需細胞量少,實驗步驟簡單,可以在全基因組范圍內檢測染色質的開放狀態、核小體位置及TF結合位點,目前已經成為研究染色質開放性的首選技術方法。加上10xGenomics最近推出了一款新的產品—10xscATAC-seq(10x單細胞ATAC測序)。


    服務代碼:4base-ATAC-seq

    訂購指南:order@4basedx.com

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